تعمل نيابــــة مديرية الجامعة للتكوين العالي في الطور الثالث و التأهيل الجامعي و البحث العلمي و التكوين العالي فيما بعد التدرج على متابعة
تنفيذ مهمة جامعة محمد بوضياف لتطوير البحث العلمي الجامعي وتكوين دكاترة في مختلف التخصصات
إن مهمة تكوين طلبة الدكتوراه والماجستير مرتبطة ارتباطا وثيقا بمهمة تطوير البحث العلمي بحكم أن مختلف مخابر البحث العلمي وفرق البحث لمشاريع CNEPRU اوPNR تشمل طلبة الدكتوراه والماجستير بهدف تجسيد عملية البحث التكويني.
لقد تبنت جامعة محمد بوضياف –المسيلة- استراتيجية في تطوير التكوين في الدكتوراه تتمحور أساسا على التنويع وفتح أكبر قدر ممكن من التخصصات مع الحرص على ضمان النوعية ، و أن يكون عدد المناصب المفتوحة مدروسة وبدقة.
كما عملت الجامعة على الحصول على فروع جديد في الدكتوراه علوم ، حيث انتقلنا من 08 تخصصات فقط في 2012 إلى 16 تخصص في سنة 2015 . وقد سمح ذلك بفتح المجال امام الاساتذة المحاضرين بالجامعة للحصول على التأهيل الجامعي في هذه التخصصات ، مما سمح لهم بالترقية الى رتبة استاذ محاضر – أ-
من جهة أخرى، ارتقت الجامعة بعدد مخابر البحث العلمي من 08 مخابر قبل سنة 2010 الى 27 مخبر في سنة 2015،ما يمثل قفزة نوعيةتجسد توجه جامعة محمد بوضياف نحو تدعيم نشاطات الاساتذة الباحثين للبحث والنشر، والارتقاء بالجامعة إلى أولى المراتب لتصنيف الجامعات الوطنية والدولية وهو الهدف الرئيسي للسنتين المقبلتين.